Die Stadt Schöningen hat die Durchführung der Aufgaben der Abwasserentsorgung im Jahr 2009 auf die Kooperationsgesellschaft Elmregia GmbH übertragen. An der Gesellschaft ist die Stadt Schöningen mit 51%, die Purena mit 49 % beteiligt.
Im Rahmen eines langfristigen Investitionsprogramms erfolgt die Sanierung der Regen- und Schmutzwasserkanalnetze, mit dem Ziel der Beseitigung aller Schäden der Schadensklassen 3, 4 und 5 (nach ISYBAU). Ferner wird durch gezielte Entkoppelung von Teileinzugsgebieten, dezentrale Ableitung und Rückhaltemaßnahmen eine hydraulische Entlastung der Regenwasserkanalisation in überlasteten Bereichen erzielt. Darüber hinaus wird die Kläranlage entsprechend dem Stand der Technik aufgerüstet.
Die Kläranlage Schöningen wurde mit Anschluss der Ortsteile Esbeck und Hoiersdorf im Jahr 1996 erweitert und in Betrieb genommen. Die Anlage verfügt über eine zweistrassige Belebung mit simultaner Nitrifikation/Denitrifikation und biologischer wie chemischer Phosphorelimination.